Slovensko homeopatsko društvo že od leta 1992 organizira osnovno podiplomsko izobraževanje in usposabljanje iz homeopatije tudi za farmacevte, ki traja tri leta in obsega 160 učnih ur. Teoretični del izobraževanja je v omejenem obsegu ur skupen z zdravniki in zobozdravniki, poleg tega pa so zanje organizirani še seminarji, kjer se praktično poučijo o načinu priprave homeopatskih zdravil in nekaterih za farmacevte pomembnih homeopatskih postopkih. Za farmacevte je obvezna aktivna udeležba na seminarju iz izdelovanja homeopatskih zdravil. Cilj osnovnega triletnega izobraževanja in usposabljanje je samostojna uporaba pridobljenega znanja pri svetovanju v lekarni.

Republika Slovenija je leta 1993 pristopila h Konvenciji o izdelavi Evropske farmakopeje ter Protokolu h Konvenciji Sveta Evrope. S tem se je zavezala, da bo na svojem ozemlju sprejela in uveljavila Evropsko farmakopejo. Homeopatska zdravila so del Evropske farmakopeje in so tako postala tudi del slovenske zakonodaje. Vsi predpisi, ki urejajo področje homeopatskih zdravil v Sloveniji so usklajeni s predpisi, ki urejajo to področje v Evropski uniji.

Zakon o zdravilih (Uradni list RS, št. 31/06) in na njegovi podlagi sprejeti podzakonski predpisi urejajo izdelovanje, izdajanje in prodajo homeopatskih zdravil, tako za uporabo v humani in veterinarski medicini. V skladu z Zakonom o zdravilih morajo tudi homeopatska zdravila pridobiti dovoljenje za promet, s čimer se preveri in zagotovi njihova varnost, kakovost in učinkovitost.

Podrobneje ureja področje homeopatskih zdravil Pravilnik o homeopatskih zdravilih za uporabo v humani medicini (Uradni list RS, št. 94/2008). V skladu z navedenim pravilnikom je pooblaščena oseba za izdajanje homeopatskih zdravil, magistralnih homeopatskih pripravkov in galenskih homeopatskih izdelkov magister farmacije z opravljenim strokovnim izpitom in dodatnimi znanji s področja homeopatije. Homeopatska zdravila pa smejo predpisovati le osebe, ki imajo diplomo medicinske fakultete in pridobljena znanja iz homeopatije.

Homeopatska zdravila se uporabljajo tudi v veterinarski medicini. Na podlagi Zakona o zdravilih sta bila sprejeta dva podzakonska predpisa: Pravilnik o dovoljenju za promet z zdravilom za uporabo v veterinarski medicini (Uradni list RS, št. 64/2006) in Pravilnik o označevanju in navodilu za uporabo zdravila za uporabo v veterinarski medicini (Uradni list RS, št. 101/2009).

Svetovna zdravstvena organizacija, katere članica je tudi Slovenija, je februarja 2010 izdala smernice za pripravo homeopatskih zdravil - Safety issues in the preparation of homeopathic medicines ( http://www.who.int/medicines/areas/traditional/prephomeopathic/en/index.html ).

Homeopatska zdravila še niso na voljo v slovenskih lekarnah, ker še nobeno homeopatsko zdravilo ni pridobilo dovoljenja za promet. Javna agencija za zdravila in medicinske pripomočke do aprila 2010 ni prejela nobene popolne vloge za pridobitev dovoljenja za promet.

V Sloveniji osnovno izobraževanje in usposabljanje iz homeopatije za farmacevte izvaja tudi Lekarniška zbornica Slovenije, posamezne seminarje pa organizira tudi Homeopatska sekcija pri Slovenskem farmacevtskem društvu. Študenti dodiplomskega študija Fakultete za farmacijo Univerze v Ljubljani lahko od leta 2007 dobijo osnovne informacije o homeopatiji in homeopatskih zdravilih pri študijskem predmetu Zdravila v alternativni medicini.